קוניזציה מתבצעת לרוב בעקבות תוצאה חריגה בבדיקת פאפ או קולפוסקופיה שהדגימה נגעים בדרגה גבוהה (CIN2/3), ולעיתים היא מהווה גם טיפול מרפא כאשר הנגע מוסר בשלמותו עם שוליים נקיים. קיימות שתי טכניקות עיקריות לביצוע קוניזציה: שימוש בלולאת חשמל (LEEP או LLETZ) או כריתה בעזרת אזמל (cold knife conization), כאשר הבחירה בין השיטות תלויה בגודל הנגע, מיקומו, גיל המטופלת ושיקולים נוספים.
הפרוצדורה מתבצעת לרוב תחת הרדמה מקומית או כללית, ונמשכת כ-15–30 דקות. לאחריה צפויה הפרשה דמית או דמוית וסת למשך מספר ימים, ויש להימנע מקיום יחסי מין, החדרת טמפונים או שטיפות נרתיקיות במשך מספר שבועות. סיבוכים נדירים אך אפשריים כוללים דימום, זיהום או הצרות של תעלת צוואר הרחם. בנוסף, חשוב לדעת כי קוניזציה עלולה להשפיע על הריונות עתידיים, ולהעלות מעט את הסיכון ללידה מוקדמת או לפתיחה מוקדמת של צוואר הרחם.